Protein–RNA interactions for Protein: Q99767

APBA2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA2Q99767 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA2Q99767 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA2Q99767 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APBA2Q99767 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA2Q99767 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA2Q99767 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APBA2Q99767 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APBA2Q99767 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APBA2Q99767 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA2Q99767 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA2Q99767 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA2Q99767 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APBA2Q99767 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APBA2Q99767 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
APBA2Q99767 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA2Q99767 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBA2Q99767 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APBA2Q99767 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
APBA2Q99767 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APBA2Q99767 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBA2Q99767 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APBA2Q99767 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APBA2Q99767 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.53■■■□□ 2
APBA2Q99767 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APBA2Q99767 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APBA2Q99767 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APBA2Q99767 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA2Q99767 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA2Q99767 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA2Q99767 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APBA2Q99767 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA2Q99767 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA2Q99767 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA2Q99767 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBA2Q99767 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
APBA2Q99767 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms