Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ERGIC2Q96RQ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERGIC2Q96RQ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERGIC2Q96RQ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERGIC2Q96RQ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ERGIC2Q96RQ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERGIC2Q96RQ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERGIC2Q96RQ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERGIC2Q96RQ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERGIC2Q96RQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERGIC2Q96RQ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms