Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED8Q8IZ13 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBED8Q8IZ13 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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