Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNL1Q8IU54 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNL1Q8IU54 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFNL1Q8IU54 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFNL1Q8IU54 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms