Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SOGA3Q5TF21 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SOGA3Q5TF21 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SOGA3Q5TF21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SOGA3Q5TF21 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms