Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
NBPF8Q3BBV2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NBPF8Q3BBV2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NBPF8Q3BBV2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms