Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NECTIN1Q15223 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NECTIN1Q15223 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NECTIN1Q15223 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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