Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3AQ05086 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3AQ05086 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3AQ05086 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms