Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC25A11Q02978 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC25A11Q02978 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms