Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK11-1P61568 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK11-1P61568 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms