Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DCCP43146 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DCCP43146 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DCCP43146 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DCCP43146 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
DCCP43146 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DCCP43146 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
DCCP43146 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
DCCP43146 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DCCP43146 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
DCCP43146 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
DCCP43146 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
DCCP43146 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
DCCP43146 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
DCCP43146 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
DCCP43146 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
DCCP43146 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
DCCP43146 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DCCP43146 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DCCP43146 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DCCP43146 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DCCP43146 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DCCP43146 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DCCP43146 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DCCP43146 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
DCCP43146 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DCCP43146 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DCCP43146 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DCCP43146 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DCCP43146 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DCCP43146 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DCCP43146 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DCCP43146 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DCCP43146 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DCCP43146 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
DCCP43146 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DCCP43146 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
DCCP43146 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
DCCP43146 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DCCP43146 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DCCP43146 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DCCP43146 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DCCP43146 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
DCCP43146 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
DCCP43146 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DCCP43146 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DCCP43146 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DCCP43146 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DCCP43146 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DCCP43146 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
DCCP43146 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DCCP43146 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
DCCP43146 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
DCCP43146 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
DCCP43146 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
DCCP43146 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DCCP43146 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DCCP43146 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DCCP43146 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DCCP43146 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DCCP43146 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DCCP43146 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DCCP43146 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DCCP43146 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
DCCP43146 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DCCP43146 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DCCP43146 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DCCP43146 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DCCP43146 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DCCP43146 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DCCP43146 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DCCP43146 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DCCP43146 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DCCP43146 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DCCP43146 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
DCCP43146 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DCCP43146 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DCCP43146 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DCCP43146 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DCCP43146 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCCP43146 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCCP43146 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
DCCP43146 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCCP43146 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCCP43146 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCCP43146 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCCP43146 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCCP43146 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
DCCP43146 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCCP43146 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCCP43146 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
DCCP43146 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
DCCP43146 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.8■■■■□ 3
DCCP43146 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
DCCP43146 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DCCP43146 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DCCP43146 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
DCCP43146 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
DCCP43146 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
DCCP43146 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms