Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP1P29466 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP1P29466 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP1P29466 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP1P29466 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP1P29466 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP1P29466 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP1P29466 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP1P29466 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP1P29466 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP1P29466 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP1P29466 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP1P29466 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP1P29466 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP1P29466 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP1P29466 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP1P29466 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP1P29466 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP1P29466 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP1P29466 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP1P29466 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP1P29466 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP1P29466 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP1P29466 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP1P29466 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP1P29466 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CASP1P29466 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CASP1P29466 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP1P29466 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP1P29466 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP1P29466 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP1P29466 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP1P29466 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP1P29466 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP1P29466 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP1P29466 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP1P29466 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP1P29466 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP1P29466 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP1P29466 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP1P29466 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP1P29466 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP1P29466 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP1P29466 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP1P29466 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP1P29466 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP1P29466 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP1P29466 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP1P29466 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP1P29466 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP1P29466 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP1P29466 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP1P29466 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CASP1P29466 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CASP1P29466 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CASP1P29466 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CASP1P29466 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP1P29466 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP1P29466 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP1P29466 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP1P29466 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP1P29466 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP1P29466 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP1P29466 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP1P29466 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP1P29466 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP1P29466 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP1P29466 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP1P29466 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP1P29466 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP1P29466 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP1P29466 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP1P29466 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP1P29466 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP1P29466 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP1P29466 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP1P29466 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP1P29466 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASP1P29466 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASP1P29466 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP1P29466 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP1P29466 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP1P29466 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP1P29466 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP1P29466 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP1P29466 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP1P29466 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP1P29466 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP1P29466 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP1P29466 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP1P29466 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP1P29466 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP1P29466 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP1P29466 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP1P29466 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP1P29466 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP1P29466 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP1P29466 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP1P29466 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP1P29466 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms