Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NELFEP18615 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFEP18615 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFEP18615 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFEP18615 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFEP18615 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFEP18615 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFEP18615 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NELFEP18615 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFEP18615 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFEP18615 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFEP18615 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFEP18615 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFEP18615 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFEP18615 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFEP18615 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFEP18615 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFEP18615 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NELFEP18615 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFEP18615 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFEP18615 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFEP18615 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFEP18615 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFEP18615 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFEP18615 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFEP18615 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NELFEP18615 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFEP18615 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFEP18615 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFEP18615 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFEP18615 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFEP18615 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NELFEP18615 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFEP18615 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NELFEP18615 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NELFEP18615 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NELFEP18615 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NELFEP18615 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFEP18615 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFEP18615 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFEP18615 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFEP18615 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFEP18615 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFEP18615 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFEP18615 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFEP18615 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFEP18615 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFEP18615 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFEP18615 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFEP18615 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFEP18615 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFEP18615 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFEP18615 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFEP18615 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFEP18615 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFEP18615 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFEP18615 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFEP18615 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFEP18615 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFEP18615 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFEP18615 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFEP18615 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFEP18615 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFEP18615 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFEP18615 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFEP18615 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFEP18615 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFEP18615 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFEP18615 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFEP18615 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFEP18615 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFEP18615 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFEP18615 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFEP18615 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFEP18615 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFEP18615 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFEP18615 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFEP18615 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NELFEP18615 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NELFEP18615 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NELFEP18615 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFEP18615 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFEP18615 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFEP18615 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFEP18615 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFEP18615 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFEP18615 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms