Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN2P0C2S0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN2P0C2S0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms