Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
S1PR4O95977 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
S1PR4O95977 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
S1PR4O95977 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
S1PR4O95977 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
S1PR4O95977 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
S1PR4O95977 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
S1PR4O95977 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
S1PR4O95977 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
S1PR4O95977 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms