Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL13O43927 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL13O43927 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms