Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC8O43402 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC8O43402 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC8O43402 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC8O43402 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC8O43402 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC8O43402 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC8O43402 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC8O43402 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC8O43402 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC8O43402 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC8O43402 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC8O43402 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC8O43402 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EMC8O43402 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMC8O43402 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMC8O43402 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMC8O43402 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC8O43402 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC8O43402 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC8O43402 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC8O43402 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC8O43402 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC8O43402 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC8O43402 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC8O43402 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC8O43402 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC8O43402 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC8O43402 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC8O43402 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC8O43402 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC8O43402 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC8O43402 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC8O43402 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC8O43402 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC8O43402 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC8O43402 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC8O43402 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC8O43402 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC8O43402 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC8O43402 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC8O43402 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC8O43402 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC8O43402 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC8O43402 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC8O43402 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC8O43402 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC8O43402 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC8O43402 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC8O43402 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMC8O43402 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMC8O43402 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMC8O43402 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMC8O43402 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMC8O43402 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMC8O43402 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC8O43402 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC8O43402 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC8O43402 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC8O43402 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC8O43402 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC8O43402 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC8O43402 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC8O43402 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC8O43402 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC8O43402 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC8O43402 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC8O43402 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC8O43402 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC8O43402 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC8O43402 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC8O43402 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC8O43402 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC8O43402 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC8O43402 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC8O43402 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC8O43402 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC8O43402 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC8O43402 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC8O43402 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC8O43402 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC8O43402 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC8O43402 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC8O43402 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC8O43402 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC8O43402 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC8O43402 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC8O43402 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC8O43402 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.4 ms