Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF9O43307 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF9O43307 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF9O43307 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms