Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAFD1O14545 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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