Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QQQ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QQQ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QQQ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QQQ9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QQQ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QQQ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QQQ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QQQ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QQQ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QQQ9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QQQ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QQQ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QQQ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QQQ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QQQ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QQQ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QQQ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QQQ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QQQ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QQQ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QQQ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QQQ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QQQ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QQQ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QQQ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QQQ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QQQ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QQQ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QQQ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QQQ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QQQ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QQQ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QQQ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QQQ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QQQ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QQQ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QQQ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QQQ9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QQQ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QQQ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QQQ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QQQ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QQQ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QQQ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QQQ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QQQ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QQQ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QQQ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QQQ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QQQ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QQQ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QQQ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QQQ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QQQ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QQQ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QQQ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QQQ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QQQ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QQQ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QQQ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms