Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FARP1Q9Y4F1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FARP1Q9Y4F1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms