Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18L2Q9UHA2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18L2Q9UHA2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms