Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED17Q9NVC6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED17Q9NVC6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED17Q9NVC6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED17Q9NVC6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms