Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNG6Q9BXT2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNG6Q9BXT2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms