Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCLRE1CQ96SD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1CQ96SD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms