Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN5

TCEANC2, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEANC2Q96MN5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCEANC2Q96MN5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TCEANC2Q96MN5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TCEANC2Q96MN5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCEANC2Q96MN5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCEANC2Q96MN5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms