Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS50Q96JG6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS50Q96JG6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS50Q96JG6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS50Q96JG6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms