Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC45Q96CN5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC45Q96CN5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC45Q96CN5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms