Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM63Q969Q1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms