Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COBLL1Q53SF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
COBLL1Q53SF7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms