Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.183e-15■■■■■ 53.5
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SF3B4Q15427 KDM6A-204ENST00000431196 735 ntTSL 32.69□□□□□ -1.981e-9■■■■■ 53.5
SF3B4Q15427 UBE2J2-212ENST00000467339 515 ntTSL 29.66□□□□□ -0.861e-11■■■■■ 53.5
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SF3B4Q15427 STX17-208ENST00000529340 858 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.526e-11■■■■■ 52.6
SF3B4Q15427 STX17-206ENST00000525847 828 ntTSL 311.18□□□□□ -0.626e-11■■■■■ 52.6
SF3B4Q15427 STX17-201ENST00000259400 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.886e-11■■■■■ 52.6
SF3B4Q15427 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.86e-9■■■■■ 52.6
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SF3B4Q15427 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 217.47■□□□□ 0.392e-8■■■■■ 52.6
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SF3B4Q15427 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 212.42□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 52.6
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SF3B4Q15427 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.183e-15■■■■■ 52.5
SF3B4Q15427 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.34□□□□□ -0.113e-15■■■■■ 52.5
SF3B4Q15427 ADD1-227ENST00000541051 975 ntTSL 211.13□□□□□ -0.631e-11■■■■■ 52.5
SF3B4Q15427 MIIP-207ENST00000498685 1392 ntTSL 215.92■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 52.5
SF3B4Q15427 MIIP-203ENST00000466860 1709 ntTSL 515.63■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 52.5
SF3B4Q15427 MIIP-202ENST00000460823 955 ntTSL 513.68□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 52.5
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