RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469137.5

LIN7B-204, Transcript of lin-7 homolog B, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene LIN7B, Length 1,057 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7B-204ENST00000469137 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.79■■■■■ 8.92
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LIN7B-204ENST00000469137 ABCC9O60706 1549 aa63.28■■■■■ 7.72
LIN7B-204ENST00000469137 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.41■■■■■ 7.26
LIN7B-204ENST00000469137 NACADO15069 1562 aa60.03■■■■■ 7.2
LIN7B-204ENST00000469137 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.58■■■■■ 7.13
LIN7B-204ENST00000469137 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.27■■■■■ 7.08
LIN7B-204ENST00000469137 DNAJC5BQ9UF47 199 aa59.12■■■■■ 7.05
LIN7B-204ENST00000469137 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.03■■■■■ 7.04
LIN7B-204ENST00000469137 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.87■■■■■ 7.01
LIN7B-204ENST00000469137 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.72■■■■■ 6.99
LIN7B-204ENST00000469137 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.57■■■■■ 6.97
LIN7B-204ENST00000469137 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.55■■■■■ 6.96
LIN7B-204ENST00000469137 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.93■■■■■ 6.86
LIN7B-204ENST00000469137 SCRIBQ14160 1630 aa57.83■■■■■ 6.85
LIN7B-204ENST00000469137 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.22■■■■■ 6.75
LIN7B-204ENST00000469137 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57.15■■■■■ 6.74
LIN7B-204ENST00000469137 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.02■■■■■ 6.72
LIN7B-204ENST00000469137 NCAPD3P42695 1498 aa55.37■■■■■ 6.45
LIN7B-204ENST00000469137 SMARCA4P51532 1647 aa55.22■■■■■ 6.43
LIN7B-204ENST00000469137 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.19■■■■■ 6.43
LIN7B-204ENST00000469137 SMARCA2P51531 1590 aa55.13■■■■■ 6.42
LIN7B-204ENST00000469137 HMGXB3Q12766 1538 aa55.02■■■■■ 6.4
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LIN7B-204ENST00000469137 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.71■■■■■ 6.35
LIN7B-204ENST00000469137 ERCC6Q03468 1493 aa54.7■■■■■ 6.35
LIN7B-204ENST00000469137 CUX2O14529 1486 aa54.58■■■■■ 6.33
LIN7B-204ENST00000469137 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.51■■■■■ 6.32
LIN7B-204ENST00000469137 NESP48681 1621 aa54.38■■■■■ 6.3
LIN7B-204ENST00000469137 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.28■■■■■ 6.28
LIN7B-204ENST00000469137 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.15■■■■■ 6.26
LIN7B-204ENST00000469137 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.89■■■■■ 6.22
LIN7B-204ENST00000469137 WIZO95785 1651 aa53.88■■■■■ 6.22
LIN7B-204ENST00000469137 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.8■■■■■ 6.2
LIN7B-204ENST00000469137 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.78■■■■■ 6.2
LIN7B-204ENST00000469137 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.67■■■■■ 6.18
LIN7B-204ENST00000469137 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.42■■■■■ 6.14
LIN7B-204ENST00000469137 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.33■■■■■ 6.13
LIN7B-204ENST00000469137 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.26■■■■■ 6.12
LIN7B-204ENST00000469137 WDR62O43379 1518 aa53.21■■■■■ 6.11
LIN7B-204ENST00000469137 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.15■■■■■ 6.1
LIN7B-204ENST00000469137 CFTRP13569 1480 aa53.11■■■■■ 6.09
LIN7B-204ENST00000469137 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.07■■■■■ 6.09
LIN7B-204ENST00000469137 PRDM2Q13029 1718 aa52.71■■■■■ 6.03
LIN7B-204ENST00000469137 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.61■■■■■ 6.01
LIN7B-204ENST00000469137 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.59■■■■■ 6.01
LIN7B-204ENST00000469137 TOPBP1Q92547 1522 aa52.09■■■■■ 5.93
LIN7B-204ENST00000469137 IFT140Q96RY7 1462 aa52.07■■■■■ 5.93
LIN7B-204ENST00000469137 ABCC8Q09428 1581 aa52.05■■■■■ 5.92
LIN7B-204ENST00000469137 OSCARQ8IYS5 282 aa52.04■■■■■ 5.92
LIN7B-204ENST00000469137 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.95■■■■■ 5.91
LIN7B-204ENST00000469137 TRIM41Q8WV44 630 aa51.94■■■■■ 5.91
LIN7B-204ENST00000469137 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.9■■■■■ 5.9
LIN7B-204ENST00000469137 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.72■■■■■ 5.87
LIN7B-204ENST00000469137 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.64■■■■■ 5.86
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LIN7B-204ENST00000469137 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.38■■■■■ 5.82
LIN7B-204ENST00000469137 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.38■■■■■ 5.82
LIN7B-204ENST00000469137 SOGA1O94964 1423 aa51.31■■■■■ 5.8
LIN7B-204ENST00000469137 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.31■■■■■ 5.8
LIN7B-204ENST00000469137 CHD1O14646 1710 aa51.31■■■■■ 5.8
LIN7B-204ENST00000469137 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.26■■■■■ 5.8
LIN7B-204ENST00000469137 ARHGEF11O15085 1522 aa51.23■■■■■ 5.79
LIN7B-204ENST00000469137 CUX1P39880 1505 aa51.23■■■■■ 5.79
LIN7B-204ENST00000469137 WDR97A6NE52 1622 aa51.21■■■■■ 5.79
LIN7B-204ENST00000469137 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.15■■■■■ 5.78
LIN7B-204ENST00000469137 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.11■■■■■ 5.77
LIN7B-204ENST00000469137 FBLN2P98095 1184 aa51.08■■■■■ 5.77
LIN7B-204ENST00000469137 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.97■■■■■ 5.75
LIN7B-204ENST00000469137 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.91■■■■■ 5.74
LIN7B-204ENST00000469137 GRIN2BQ13224 1484 aa50.89■■■■■ 5.74
LIN7B-204ENST00000469137 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.77■■■■■ 5.72
LIN7B-204ENST00000469137 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.77■■■■■ 5.72
LIN7B-204ENST00000469137 PBRM1Q86U86 1689 aa50.75■■■■■ 5.71
LIN7B-204ENST00000469137 SYNJ1O43426 1573 aa50.73■■■■■ 5.71
LIN7B-204ENST00000469137 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.72■■■■■ 5.71
LIN7B-204ENST00000469137 SYNJ2O15056 1496 aa50.71■■■■■ 5.71
LIN7B-204ENST00000469137 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.71■■■■■ 5.71
LIN7B-204ENST00000469137 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.71■■■■■ 5.71
LIN7B-204ENST00000469137 ARAP1Q96P48 1450 aa50.71■■■■■ 5.71
LIN7B-204ENST00000469137 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.64■■■■■ 5.7
LIN7B-204ENST00000469137 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.53■■■■■ 5.68
LIN7B-204ENST00000469137 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.51■■■■■ 5.68
LIN7B-204ENST00000469137 TOP2BQ02880 1626 aa50.5■■■■■ 5.67
LIN7B-204ENST00000469137 ADAMTS12P58397 1594 aa50.25■■■■■ 5.63
LIN7B-204ENST00000469137 GRIN2AQ12879 1464 aa50.24■■■■■ 5.63
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LIN7B-204ENST00000469137 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.11■■■■■ 5.61
LIN7B-204ENST00000469137 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.09■■■■■ 5.61
LIN7B-204ENST00000469137 NUP160Q12769 1436 aa50.05■■■■■ 5.6
LIN7B-204ENST00000469137 CEP170Q5SW79 1584 aa50.04■■■■■ 5.6
LIN7B-204ENST00000469137 SHROOM2Q13796 1616 aa49.85■■■■■ 5.57
LIN7B-204ENST00000469137 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.85■■■■■ 5.57
LIN7B-204ENST00000469137 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.55■■■■■ 5.52
LIN7B-204ENST00000469137 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.53■■■■■ 5.52
LIN7B-204ENST00000469137 KIF27Q86VH2 1401 aa49.51■■■■■ 5.52
LIN7B-204ENST00000469137 JPH4Q96JJ6 628 aa49.49■■■■■ 5.51
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