RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.35■■■□□ 2.45
TOP3B-206ENST00000436282 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.77■■□□□ 1.72
TOP3B-206ENST00000436282 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TOP3B-206ENST00000436282 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.55■■□□□ 1.68
TOP3B-206ENST00000436282 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TOP3B-206ENST00000436282 HRCP23327 699 aa24.95■■□□□ 1.59
TOP3B-206ENST00000436282 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.88■■□□□ 1.57
TOP3B-206ENST00000436282 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-206ENST00000436282 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-206ENST00000436282 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.54■■□□□ 1.52
TOP3B-206ENST00000436282 SCRIBQ14160 1630 aa24.29■■□□□ 1.48
TOP3B-206ENST00000436282 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC9O60706 1549 aa24.28■■□□□ 1.48
TOP3B-206ENST00000436282 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.06■■□□□ 1.44
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TOP3B-206ENST00000436282 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
TOP3B-206ENST00000436282 NACADO15069 1562 aa23.95■■□□□ 1.42
TOP3B-206ENST00000436282 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.76■■□□□ 1.39
TOP3B-206ENST00000436282 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TOP3B-206ENST00000436282 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.69■■□□□ 1.38
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM41Q8WV44 630 aa23.64■■□□□ 1.37
TOP3B-206ENST00000436282 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.62■■□□□ 1.37
TOP3B-206ENST00000436282 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TOP3B-206ENST00000436282 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TOP3B-206ENST00000436282 WIZO95785 1651 aa23.46■■□□□ 1.35
TOP3B-206ENST00000436282 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.41■■□□□ 1.34
TOP3B-206ENST00000436282 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
TOP3B-206ENST00000436282 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TOP3B-206ENST00000436282 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
TOP3B-206ENST00000436282 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.17■■□□□ 1.3
TOP3B-206ENST00000436282 SMARCA4P51532 1647 aa23.13■■□□□ 1.29
TOP3B-206ENST00000436282 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.03■■□□□ 1.28
TOP3B-206ENST00000436282 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.96■■□□□ 1.27
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TOP3B-206ENST00000436282 SMARCA2P51531 1590 aa22.94■■□□□ 1.26
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC8Q09428 1581 aa22.93■■□□□ 1.26
TOP3B-206ENST00000436282 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TOP3B-206ENST00000436282 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TOP3B-206ENST00000436282 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TOP3B-206ENST00000436282 NEUROD1Q13562 356 aa22.82■■□□□ 1.24
TOP3B-206ENST00000436282 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TOP3B-206ENST00000436282 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
TOP3B-206ENST00000436282 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TOP3B-206ENST00000436282 SOGA1O94964 1423 aa22.71■■□□□ 1.23
TOP3B-206ENST00000436282 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.65■■□□□ 1.22
TOP3B-206ENST00000436282 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.64■■□□□ 1.21
TOP3B-206ENST00000436282 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.62■■□□□ 1.21
TOP3B-206ENST00000436282 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.6■■□□□ 1.21
TOP3B-206ENST00000436282 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.6■■□□□ 1.21
TOP3B-206ENST00000436282 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TOP3B-206ENST00000436282 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TOP3B-206ENST00000436282 CEP162Q5TB80 1403 aa22.59■■□□□ 1.21
TOP3B-206ENST00000436282 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TOP3B-206ENST00000436282 MYT1Q01538 1121 aa22.52■■□□□ 1.2
TOP3B-206ENST00000436282 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.52■■□□□ 1.2
TOP3B-206ENST00000436282 EEA1Q15075 1411 aa22.47■■□□□ 1.19
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TOP3B-206ENST00000436282 SYNJ1O43426 1573 aa22.41■■□□□ 1.18
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA3Q08378 1498 aa22.36■■□□□ 1.17
TOP3B-206ENST00000436282 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TOP3B-206ENST00000436282 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.24■■□□□ 1.15
TOP3B-206ENST00000436282 NCAPD3P42695 1498 aa22.2■■□□□ 1.14
TOP3B-206ENST00000436282 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TOP3B-206ENST00000436282 MIER1Q8N108 512 aa22.17■■□□□ 1.14
TOP3B-206ENST00000436282 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.15■■□□□ 1.14
TOP3B-206ENST00000436282 CLIP1P30622 1438 aa22.15■■□□□ 1.14
TOP3B-206ENST00000436282 KIF21BO75037 1637 aa22.14■■□□□ 1.13
TOP3B-206ENST00000436282 HMGXB3Q12766 1538 aa22.13■■□□□ 1.13
TOP3B-206ENST00000436282 TOP2BQ02880 1626 aa22.11■■□□□ 1.13
TOP3B-206ENST00000436282 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TOP3B-206ENST00000436282 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3B-206ENST00000436282 APLP2Q06481 763 aa22.04■■□□□ 1.12
TOP3B-206ENST00000436282 CUX1P39880 1505 aa21.99■■□□□ 1.11
TOP3B-206ENST00000436282 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.98■■□□□ 1.11
TOP3B-206ENST00000436282 CFTRP13569 1480 aa21.98■■□□□ 1.11
TOP3B-206ENST00000436282 KIF27Q86VH2 1401 aa21.9■■□□□ 1.1
TOP3B-206ENST00000436282 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.89■■□□□ 1.1
TOP3B-206ENST00000436282 PRXQ9BXM0 1461 aa21.89■■□□□ 1.09
TOP3B-206ENST00000436282 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.83■■□□□ 1.08
TOP3B-206ENST00000436282 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.81■■□□□ 1.08
TOP3B-206ENST00000436282 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TOP3B-206ENST00000436282 CUX2O14529 1486 aa21.75■■□□□ 1.07
TOP3B-206ENST00000436282 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.75■■□□□ 1.07
TOP3B-206ENST00000436282 ARAP1Q96P48 1450 aa21.74■■□□□ 1.07
TOP3B-206ENST00000436282 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TOP3B-206ENST00000436282 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TOP3B-206ENST00000436282 IGF1RP08069 1367 aa21.68■■□□□ 1.06
TOP3B-206ENST00000436282 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.67■■□□□ 1.06
TOP3B-206ENST00000436282 PRDM2Q13029 1718 aa21.62■■□□□ 1.05
TOP3B-206ENST00000436282 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TOP3B-206ENST00000436282 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-206ENST00000436282 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-206ENST00000436282 NESP48681 1621 aa21.55■■□□□ 1.04
TOP3B-206ENST00000436282 P3H3Q8IVL6 736 aa21.53■■□□□ 1.04
TOP3B-206ENST00000436282 ITGAEP38570 1179 aa21.53■■□□□ 1.04
TOP3B-206ENST00000436282 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-206ENST00000436282 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.5■■□□□ 1.03
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