Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ANKRD1Q15327 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANKRD1Q15327 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ANKRD1Q15327 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD1Q15327 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms