Protein–RNA interactions for Protein: Q14114

LRP8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8Q14114 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP8Q14114 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP8Q14114 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP8Q14114 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP8Q14114 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP8Q14114 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms