Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCG1P45844 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCG1P45844 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms