Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTHFRP42898 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFRP42898 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFRP42898 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms