Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARL1P40616 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL1P40616 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL1P40616 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL1P40616 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL1P40616 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL1P40616 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL1P40616 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL1P40616 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL1P40616 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL1P40616 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL1P40616 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL1P40616 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL1P40616 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL1P40616 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARL1P40616 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARL1P40616 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARL1P40616 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARL1P40616 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARL1P40616 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARL1P40616 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL1P40616 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL1P40616 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL1P40616 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL1P40616 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL1P40616 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL1P40616 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL1P40616 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL1P40616 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL1P40616 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL1P40616 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL1P40616 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL1P40616 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL1P40616 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL1P40616 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL1P40616 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL1P40616 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL1P40616 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL1P40616 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL1P40616 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL1P40616 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL1P40616 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL1P40616 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL1P40616 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL1P40616 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL1P40616 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL1P40616 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL1P40616 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL1P40616 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL1P40616 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL1P40616 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL1P40616 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL1P40616 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL1P40616 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL1P40616 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL1P40616 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL1P40616 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL1P40616 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL1P40616 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL1P40616 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL1P40616 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL1P40616 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL1P40616 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL1P40616 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL1P40616 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL1P40616 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL1P40616 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL1P40616 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL1P40616 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL1P40616 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL1P40616 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL1P40616 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL1P40616 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL1P40616 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL1P40616 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL1P40616 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL1P40616 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL1P40616 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL1P40616 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL1P40616 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL1P40616 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL1P40616 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL1P40616 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL1P40616 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL1P40616 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL1P40616 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARL1P40616 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARL1P40616 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms