Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTRLP40313 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTRLP40313 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTRLP40313 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTRLP40313 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTRLP40313 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTRLP40313 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTRLP40313 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTRLP40313 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTRLP40313 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTRLP40313 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTRLP40313 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTRLP40313 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTRLP40313 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTRLP40313 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTRLP40313 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTRLP40313 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTRLP40313 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTRLP40313 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTRLP40313 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTRLP40313 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTRLP40313 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTRLP40313 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTRLP40313 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTRLP40313 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTRLP40313 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTRLP40313 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTRLP40313 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTRLP40313 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTRLP40313 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTRLP40313 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTRLP40313 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTRLP40313 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTRLP40313 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTRLP40313 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTRLP40313 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTRLP40313 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTRLP40313 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTRLP40313 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRLP40313 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRLP40313 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRLP40313 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRLP40313 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRLP40313 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRLP40313 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRLP40313 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRLP40313 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRLP40313 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRLP40313 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRLP40313 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRLP40313 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRLP40313 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRLP40313 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRLP40313 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRLP40313 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRLP40313 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRLP40313 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRLP40313 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRLP40313 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRLP40313 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRLP40313 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRLP40313 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRLP40313 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRLP40313 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTRLP40313 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTRLP40313 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRLP40313 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRLP40313 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRLP40313 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRLP40313 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRLP40313 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRLP40313 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRLP40313 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRLP40313 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRLP40313 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms