Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRIP30626 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRIP30626 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRIP30626 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRIP30626 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRIP30626 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRIP30626 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRIP30626 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRIP30626 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRIP30626 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRIP30626 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRIP30626 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRIP30626 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRIP30626 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRIP30626 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRIP30626 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRIP30626 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRIP30626 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRIP30626 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SRIP30626 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRIP30626 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRIP30626 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRIP30626 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRIP30626 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRIP30626 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRIP30626 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRIP30626 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRIP30626 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRIP30626 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRIP30626 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRIP30626 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRIP30626 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRIP30626 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRIP30626 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRIP30626 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRIP30626 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRIP30626 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRIP30626 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRIP30626 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRIP30626 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRIP30626 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRIP30626 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRIP30626 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRIP30626 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRIP30626 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRIP30626 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRIP30626 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRIP30626 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRIP30626 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRIP30626 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRIP30626 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRIP30626 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRIP30626 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRIP30626 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRIP30626 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRIP30626 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRIP30626 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRIP30626 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRIP30626 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRIP30626 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRIP30626 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRIP30626 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRIP30626 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRIP30626 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRIP30626 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRIP30626 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRIP30626 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRIP30626 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRIP30626 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRIP30626 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRIP30626 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRIP30626 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRIP30626 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRIP30626 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRIP30626 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRIP30626 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRIP30626 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRIP30626 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms