Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SETD1AO15047 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SETD1AO15047 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SETD1AO15047 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SETD1AO15047 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms