Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRTO14522 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PTPRTO14522 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRTO14522 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRTO14522 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
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