Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227AF5H4B4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms