Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TMEM50B-203ENST00000441128 634 ntTSL 56□□□□□ -1.456e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 TMEM50B-202ENST00000432504 619 ntTSL 55.85□□□□□ -1.476e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SEC14L1-228ENST00000591786 548 ntTSL 45.63□□□□□ -1.516e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 NFIA-211ENST00000482020 552 ntTSL 35.36□□□□□ -1.556e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.576e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.586e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 KMT2C-208ENST00000473186 12854 ntTSL 1 (best)4.15□□□□□ -1.746e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.766e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 USP42-202ENST00000404008 1380 ntTSL 228.32■■■□□ 2.124e-6■■□□□ 11.5
TARDBPQ13148 USP42-205ENST00000465073 1490 ntTSL 523.32■■□□□ 1.324e-6■■□□□ 11.5
TARDBPQ13148 USP42-207ENST00000521713 5017 ntTSL 515.57■□□□□ 0.084e-6■■□□□ 11.5
TARDBPQ13148 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.084e-6■■□□□ 11.5
TARDBPQ13148 USP42-206ENST00000479544 4286 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.34e-6■■□□□ 11.5
TARDBPQ13148 USP42-203ENST00000426246 3611 ntTSL 212.82□□□□□ -0.364e-6■■□□□ 11.5
TARDBPQ13148 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.323e-6■■□□□ 11.5
TARDBPQ13148 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.543e-6■■□□□ 11.5
TARDBPQ13148 ANKRD36-206ENST00000620383 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.733e-6■■□□□ 11.5
TARDBPQ13148 MCM3AP-205ENST00000479557 364 ntTSL 26.49□□□□□ -1.371e-11■■□□□ 11.5
TARDBPQ13148 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.267e-13■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.917e-13■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.667e-13■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.273e-8■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.227e-13■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.057e-13■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 H2AFV-203ENST00000349299 596 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.917e-13■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 RBM17-205ENST00000446108 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -13e-8■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 RBM17-212ENST00000496762 1585 ntTSL 27.08□□□□□ -1.283e-8■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 RBM17-207ENST00000465906 914 ntTSL 27.01□□□□□ -1.293e-8■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 RBM17-208ENST00000467080 837 ntTSL 27.01□□□□□ -1.293e-8■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 RBM17-210ENST00000476706 927 ntTSL 26.38□□□□□ -1.393e-8■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.417e-13■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 MAP3K20-207ENST00000480606 821 ntTSL 53.89□□□□□ -1.792e-8■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 RAP1GAP-202ENST00000317967 600 ntTSL 215.84■□□□□ 0.136e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 RAP1GAP-207ENST00000447293 429 ntTSL 211.19□□□□□ -0.626e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 RAP1GAP-210ENST00000482984 331 ntTSL 56.09□□□□□ -1.436e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.626e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 516.19■□□□□ 0.183e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 214.72□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.543e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.863e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 UBAP2L-214ENST00000475373 838 ntTSL 29.15□□□□□ -0.942e-10■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.983e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 METAP2-207ENST00000549502 513 ntTSL 46.93□□□□□ -1.33e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 METAP2-206ENST00000549136 388 ntTSL 26.87□□□□□ -1.313e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 UBAP2L-218ENST00000493867 677 ntTSL 34.92□□□□□ -1.622e-10■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.645e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.235e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PTPN4-207ENST00000460162 623 ntTSL 423.1■■□□□ 1.295e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PTPN4-208ENST00000460289 577 ntTSL 422.96■■□□□ 1.275e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PTPN4-211ENST00000488279 662 ntTSL 522.93■■□□□ 1.265e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PTPN4-202ENST00000420482 568 ntTSL 421.59■■□□□ 1.055e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 TULP4-207ENST00000620026 680 ntTSL 421.21■□□□□ 0.995e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 INVS-205ENST00000466647 767 ntTSL 317.6■□□□□ 0.415e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.125e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 INVS-207ENST00000496467 714 ntTSL 215.36■□□□□ 0.055e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 FADS3-206ENST00000527379 768 ntTSL 314.61□□□□□ -0.071e-8■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.155e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.255e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 CNOT10-205ENST00000435630 2290 ntTSL 1 (best)11.95□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 INVS-202ENST00000262457 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.555e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 AC008014.1-203ENST00000611243 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.955e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 INVS-204ENST00000460636 954 ntTSL 58.22□□□□□ -1.095e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 CNOT10-204ENST00000430408 687 ntTSL 37.4□□□□□ -1.225e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 USP10-217ENST00000569925 572 ntTSL 36.76□□□□□ -1.335e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.365e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PPP2CB-207ENST00000520500 603 ntTSL 46.35□□□□□ -1.395e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 CNOT10-203ENST00000416457 2096 ntTSL 26.31□□□□□ -1.45e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PPP2CB-205ENST00000520056 755 ntTSL 56.24□□□□□ -1.415e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PTPN4-210ENST00000485247 590 ntTSL 35.75□□□□□ -1.495e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 USP10-214ENST00000567526 330 ntTSL 35.38□□□□□ -1.555e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.725e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PPP2CB-202ENST00000518243 577 ntTSL 34.12□□□□□ -1.755e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.795e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.36e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.476e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.376e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.196e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.485e-7■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.485e-7■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 KIF22-206ENST00000565736 1568 ntTSL 217.7■□□□□ 0.425e-7■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.145e-7■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.55e-7■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 KIF22-207ENST00000568312 781 ntTSL 311.77□□□□□ -0.535e-7■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 PDCD6-209ENST00000512466 3763 ntTSL 210.27□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 TBPL1-202ENST00000367869 623 ntTSL 317.9■□□□□ 0.464e-8■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.454e-8■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 TBPL1-205ENST00000457715 865 ntTSL 517.22■□□□□ 0.354e-8■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.274e-8■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 TBPL1-204ENST00000416965 991 ntTSL 314.53□□□□□ -0.084e-8■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.844e-8■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.292e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 PDCD6-208ENST00000511482 878 ntTSL 58.91□□□□□ -0.982e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.326e-6■□□□□ 11.2
TARDBPQ13148 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.196e-6■□□□□ 11.2
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 242.9 ms