Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLEC4AQ9UMR7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms