Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPG2Q9UBF2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
COPG2Q9UBF2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG2Q9UBF2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms