Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDE1Q9NZC3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDE1Q9NZC3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GDE1Q9NZC3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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