Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A12Q9NXJ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A12Q9NXJ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms