Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJC17Q9NVM6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DNAJC17Q9NVM6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC17Q9NVM6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAJC17Q9NVM6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms