Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDEL1Q9GZM8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDEL1Q9GZM8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDEL1Q9GZM8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms